Kurikulum Program Pendidikan Profesi Apoteker terdiri dari 36 SKS yang ditempuh dalam 2 semester terdiri dari mata kuliah wajib dan mata kuliah pilihan.
Mata kuliah yang wajib diambil adalah
| Mata Kuliah | Jumlah SKS |
| Etika Keprofesian dan Organisasi | 2 |
| Farmakokinetika Terapan | 2 |
| Farmakoterapi Terapan | 2 |
| Spesialite Obat dan Alat Kesehatan | 2 |
| Manajemen Distribusi | 2 |
| Manajemen Perapotikan | 2 |
| Manajemen Industri | 3 |
| Kepemimpinan | 1 |
| Penanganan Sediaan Steril dan Sitostatika | 2 |
| Praktik Kerja Profesi Apoteker di Apotek | 8 |
| Praktik Kerja Profesi Apoteker di Pemerintahan | 2 |
| Total SKS | 28 |
Mata kuliah pilihan yang dapat diambil tergantung dari peminatan, yaitu
| Mata Kuliah | Jumlah SKS |
| Praktik Kerja Profesi Apoteker di Rumah Sakit | 8 |
| Praktik Kerja Profesi Apoteker di Industri | 8 |
| Total SKS | 16 |
